垦鉴豆36号大豆是黑龙江省农垦总局建三江分局科研所以合丰25号为母本、建9049为父本进行有性杂交，应用系谱法进行选择的。1997年田间株行决选，代号为建97825。2004年2月通过黑龙江省农垦总局农作物品种审定委员会审定并命名。